侍从武官长仍为荫昌，总统府指挥使仍为徐邦杰，这两人是袁时代就担任这项职务，历事袁、黎、冯三位总统，可称三朝元老。
如愿当上了大总统，冯国璋看来是真心希望北洋三杰团结，以重振北洋声势。在他看来，今后府院一家，上下一致，内外一心。
他紧握着段的手说：“以后咱们再也没有什么府、院之争了。”
又对王士珍和段祺瑞说：“咱们三人从此要一条心，通力合作，在咱们三个人中间，无所谓总统、总理、参谋总长。”
王士珍很感动，段祺瑞虽表面应承着，心里不知作何想。
段祺瑞本来打算在冯入京后，即派段芝贵为江苏督军。
小段在袁世凯时代是一大红人，做过湖北督军和奉天督军，其后因帝制余孽而被边缘化了一段时间，这次讨逆有功于“再造共和”， 又可以东山再起了。
这段芝贵是有奶就是娘的人，在段祺瑞看来，用他代替冯为江苏督军，南京那边也就收到自己囊中。
那知冯国璋早有他自己的安排。他在离开南京以前，就提出调任江西督军李纯为江苏督军，升任驻南苑的第十二师长陈光远为江西督军。
原来李纯、陈光远和湖北督军王占元在北洋派中都是亲冯的。
早在镇压辛亥革命时，冯国璋统率北军第一军南下与革命军作战。第一军是由第六镇统制（即师长）李纯，第二镇协统（即旅长）王占元，第四镇协统陈光远等混合编成，此后，，他们便逐渐在北洋系中形成一个小集团，也就是后来赫赫有名的“直系”。
直系名称是因为冯国璋是直隶人，这和段祺瑞的皖系是因为段祺瑞是安徽合肥人相同。参加这两系的军阀们，并不完全是这两省人，大都因为个人利害关系。在直、皖两系明争暗斗过程中，其成员也不断变化，很难划分清楚。
冯国璋不只是安排了江苏督军，同时也将一向由他自己亲统的禁卫军扩大为两个师，
禁卫军是清朝末年成立的。那时冯为禁卫军统领，民国成立后，冯仍继续统率这支军队，名称也未变。
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冯继任总统后，禁卫军改编为两个师。以王廷桢为第十六师师长，留在南京，与由江西调来的第六师长齐燮元共同守卫江苏地盘。另以刘询为第十五师长兼总统拱卫军司令移驻北京。
这样的安排，他在北京当总统便有自己的军队，而在长江一带又有地盘。
齐燮元，原名齐英，字抚万，号耀珊。直隶宁河县（现天津市宁河县）人。光绪年间秀才。
这是个有故事之人，考中秀才后，正逢保定陆军军官学堂招收学员，齐英认为自己出人头地的时候到了，忙打点行囊奔赴保定报考。
学堂考文韬武略，齐英并不发愁，发愁的是最后体检。当时要求军官身材魁梧、五官端正。齐英身材瘦小，一只眼睛斜，想要录取谈何容易。
体检这天，报考者从高到低一字排开，齐英只能排到最后一个。
负责体检的于、杨两个教官，从队首检查到队尾，最后到了齐英面前。于教官负责责检查身材，他看了齐英不由得摇了摇了头。
齐英一看要坏，忙敬礼说道：“学生身虽小而志如鸿鹄。”
于教官听了很惊奇，这个不起眼的小个子出口竟如此不凡。
接着杨教官过来检查相貌，他看了齐英不由得嘬了一下牙花子。齐英一看又要坏，又是一个敬礼，说道：“学生眼虽斜而能识远。”
杨教官是这次考试的主考，曾看过齐英的考卷，很赏识此人，他听完齐英的申辩，点点头，笑而不语地走了。
杨教官祖籍金陵，后举家移居宁河县芦台镇，除对齐英赏识外，谁能肯定不带一丝故乡情？事后，杨教官征求于教官意见，于教官心领神会，何不顺水推舟成全此事。
就这样，齐英成了该学堂炮兵科二期学员，毕业后更名为齐燮元，开始了他直步青云的生涯。
齐燮元原任十二旅旅长，因前任师长周炳文患精神病，齐乃升任。
这支军队一直驻防江西，它的前身是武卫右军，后改第六镇，再改第六师，段祺瑞、王士珍、吴禄贞、李纯都带过这支军队。